精工致善丨热图绘制

热图是对实验数据分布情况进行分析的直观可视化方法，可以用来进行实验数据的质量控制和差异数据的具像化展示，还可以对数据和样品进行聚类，观测样品质量。

如何绘制热图？

1.进入在线分析软件

2.上传数据

数据类型选择浓度；数据格式选择样品在每一列（未配对），可根据实验数据实际情况选择样品在每一行或是每一列、配对或未配对实验；选择上传的文件，提交即可。

2.1上传文件格式说明

①有样本名和样本分组信息，文件格式需为制表符分割的TXT文件或逗号分割的CSV文件。

②靶标中不能有希腊字母α、β等，用alpha、beta等替换。

示例：

2.2检查数据格式

检查数据格式，是否有非数值数据、缺失值或其它特殊字符和标点符号，默认将缺失值及零值替换为其对应变量的最小正值的1/5。

3.数据处理

4.选择分析项目

5.参数设置

参数分别选择原始数据、自动标准化特征、Euclidean距离测量方式、ward聚类方法（可根据自己实际情况调整）。点击提交。

6.图形解读

图中每个每个彩色单元格代表一个代谢物的浓度值。红色代表高于均值，颜色越深，值越大，蓝色代表低于平均值，颜色越深，值越小。上方的树状图是将数据进行聚类分析，本质上利用的是多组值间两两的差异程度或者相似程度（比如欧式距离、相关系数等）作为依据，对多组值进行层级聚类，以最终得到样本间聚类的远近关系。

7.绘图平台

https://www.metaboanalyst.ca/

MetaboAnalyst是一个代谢组学数据分析的综合平台,当前的MetaboAnalyst (V5.0)支持原始MS光谱处理、综合数据归一化、统计分析、功能分析、荟萃分析以及与其他组学数据的综合分析。