干货分享丨代谢组学问题集锦之送检篇
在进阶篇中我们了解到代谢组学主要的检测方法和检测平台。那么要做代谢组学检测,应该如何准备样本?需要的样本类型是怎样的?今天在本篇文章中会有相关解答,学完你就不再是代谢祖学小白!
1
代谢组学要求组内生物重复数(N)是多少?
答
动物实验每组不少于10个,临床样本每组不少于30个。生物重复数的不足,不构成检测的技术障碍,主要是会影响后续数据分析的可靠性,一定数量的样本才能代表总体。
2
是送检血清还是血浆?
答
对于NMR检测来说,使用EDTA抗凝血浆是不合适的,会产生较大的信号干扰,尽量选择肝素抗凝。
对于色谱质谱检测来说,血清、血浆并没有特别的要求,但是需要互相比较的样本类型要一致。
3
血样发生溶血是否对检测有影响?
答
对NMR检测是有影响的,后续要进行PCA分析看是否异常,异常则要剔除该样本的数据。
对色谱质谱检测来说,暂未发现显著影响。
4
代谢组学样本要如何收集?
答
通常来说,需要使用液氮猝灭,再转移到-80度冰箱长期保存。但是血样、组织、细胞样品的收集过程各不相同,可以联系我们索取建议方法。
5
样本寄送必须要使用干冰吗?
答
是的,代谢需要酶的参与,酶发生作用需要液体水的存在,液氮猝灭可以使水变成玻璃态,从而让酶没有用武之地。不使用-80度冰箱或干冰,会有化冻的风险,酶又会开始工作。
6
样本可以分成多批检测吗?
答
靶向定量检测,特别是有加入内标的项目,对于不同批次是完全一致的;相对定量检测,比如非靶分析,仪器在不同时间(样品批次)的响应不尽相同,会导致不同批数据不可比。
7
检测多个项目要准备多份样本吗?
答
是的,特别是靶向定量检测,每个项目都会消耗一定量的样本,在给客户明确检测方案后,我们推荐每管样本比总量要略多一些,我们收到后会统一分装,保证样品解冻时间尽可能短,冻融次数一致。
8
除了样本,还需要寄送标准品吗?
答
我们能提供的检测项目,公司均具备相应的标准品,不需要客户额外提供。
9
代谢组学常用的分析有哪些?
答
在拿到检测结果后,往往还需要进行单变量分析、多变量分析、代谢通路、火山图、热图等后续分析。均有成熟的软件或在线工具处理,我公司可免费提供相关教程。
10
检测报告包括哪些内容?
答
包括代谢物的定量/相对定量数据、实验设备、实验方法等信息,我公司提供完善的售后服务,助力用户的成果发表。