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干货分享丨代谢组学问题集锦之基础篇

关于代谢组学你了解多少呢?小编最近发现有好多“新科研人”其实都是摸着石头过河,并且网上系统性介绍代谢组学的内容比较少。博莱克科技作为一家专业的代谢组学检测公司,整理了大家的一系列疑问,下面就跟着小编一起来学习吧!


Q1

什么是代谢?

代谢(metabolism)是生命活动中所有(生物)化学变化的总称,代谢活动是生命活动的本质特征和物质基础。

Q2

什么是代谢物?

代谢物(metabolite)亦称中间代谢物,是指生命体内参与代谢过程的小分子有机化合物,通常指相对分子质量小于1000 的氨基酸、脂肪酸、胆汁酸、维生素等内源性物质,生物大分子不包括在内。

Q3

什么是代谢组?

代谢组是指生物体内源性代谢物质的动态整体。代谢组对应两个英文单词,分别是metabonome和metabolome,他们的区别和使用参见代谢组学部分的回答。

Q4

什么是代谢组学?

代谢组学是继基因组和蛋白质组学之后发展的新兴学科,1999年英国帝国理工大学的Jeremy Nicholson等首次提出了代谢组学(metabonomics)的概念并将其定义为:“定量的描述内源性代谢物整体随时间对外界刺激而产生的变化”,这标志着代谢组学这门新兴学科的诞生,Nicholson教授作为本学科的奠基人被誉为“代谢组学之父”。


德国马普所的Oliver Fiehn等在2000年时也提出了代谢组学(metabolomics)的概念,将其定位为一个静态的过程,“全面、定量分析生物体系中所有代谢物”。


目前对代谢组学的定义实际上综合了metabonomics和meatbolomics两个概念,把代谢组学看成是一个动态变化的代谢物组成系统,研究对象既包括了机体所有代谢物,也包括对各种代谢调控因素的研究。metabonomics和metabolomics尽管在字面和概念上存在些许差异,但二者在实际工作中是通用的,没有特别的区分。

Q5

什么是代谢表型?

基因和环境相互作用决定人体特征,人体特征即表型。代谢表型(metabolic phenotype)指不同个体中小分子代谢物的定量组成及变化规律,研究基因与环境因素相互作用而影响表型形成的原理机制,寻找健康特征及疾病发生发展的表型组规律,为生物医学研究及应用提供新突破口。

Q6

为什么要研究代谢组学?

首先,对生物体系而言,基因、转录子和蛋白质的存在为某生物学事件或过程的发生奠定了物质基础,但这个事件或过程有可能不发生;而代谢物的存在反映生命过程中已经发生了的生物化学反应,其变化正是对该生物事件或过程的反映。代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。


其次,绝大多数生物由宿主和与之共进化而共生的客体共同组成,是所谓的超级生物体。研究人体需要对人本身、菌群及其相互作用等在系统水平对所发生的生物事件进行整体性认识。仅仅研究宿主本身最多只能认识正常人体的一小部分。

Q7

 代谢组学的研究对象是什么?

可以是细胞、细菌、动物的体液和组织、植物的组织等,即可以是局部,也可以是生物机体整体。譬如,尿液和血液代谢组包含了人体内每一个细胞的代谢信息(包括宿主和菌群),也包含了宿主和菌群代谢活动的相互作用。

Q8

代谢组学的研究领域有哪些?

涉及基础生命科学、药物研发、疾病生理、营养与植物药学、环境科学等诸多领域。

Q9

代谢组学的检测技术有哪些?

单一工具难以满足对代谢物绝对定性和绝对定量的要求,主要依赖分析化学中的各种“谱”学技术,包括磁共振波谱、质谱、色谱、红外和拉曼光谱、紫外-可见光谱等及其联用方法。

Q10

什么是脂质组?

脂质组(lipidome)是代谢组的一个重要子集,主要研究包括脂肪酰、甘油脂、甘油磷脂、鞘脂、固醇脂质、异戊烯醇脂、糖脂和聚酮化合物这八类脂质在生物系统中的分布。

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